Con el fin de responder a la necesidad de formación de investigación y profesionales docentes, el Departamento cuenta dos 2 programas de Magíster y un Doctorado.

• En el año 1992 inicia su funcionamiento el programa de Magíster en Ciencias de la Ingeniería Informática (MII).
• En el año 2003 comienza el Doctorado en Ingeniería Informática (DII).
• En el año 2014 se crea el Magíster en Tecnología de la Información (MTI).